一、定义不同
百花蜜和蜂巢蜜在定义上截然不同，其中百花蜜是蜜蜂采集多种植物花蜜酿成的混合蜂蜜，而蜂巢蜜则是蜜蜂完全酿制成熟并连脾带蜜一起食用的蜜脾，另外若百花蜜连巢带蜜一起食用时也可将其称作蜂巢蜜。
二、状态不同
百花蜜和蜂巢蜜在状态上天差地别，其中百花蜜是分离蜜且多为琥珀色的粘稠液体，而蜂巢蜜则是蜜蜂完全酿制成熟并封盖的蜜脾，简单来说蜂巢蜜中既有液态的成熟蜂蜜，也有蜜蜂用蜂蜡筑成并封盖的巢脾。
三、成分不同
百花蜜和蜂巢蜜在成分上完全不同，其中百花蜜的主要成分是葡萄糖和果糖，尚含少量蔗糖、氨基酸、维生素及矿物质等，而蜂巢蜜的主要成分是蜂蜜和蜂蜡，另外还含少量的蜂胶、蜂王浆、蜂花粉等蜂产品。
四、功效不同
百花蜜和蜂巢蜜在功效上大相径庭，其中百花蜜的功效主要表现在增强体质、润肠通便、缓解疲劳等方面，而蜂巢蜜除了有百花蜜所有的功效之外，尚有蜂蜡、蜂胶、蜂王浆、蜂花粉等几乎所有蜂产品的功效。
五、价格不同
百花蜜和蜂巢蜜在价格上差异明显，其中百花蜜一般在40～60元一斤，但中蜂采集山野百花酿成的土蜂蜜多在100～300元一斤，而蜂巢蜜格一般在80～300元一斤，特别是中蜂生产的蜂巢蜜比土蜂蜜还要贵一些。
综上所述，百花蜜和蜂巢蜜是截然不同的两种蜂蜜，其中百花蜜是根据蜜源构成来划分的，而蜂巢蜜则是根据生产工艺来划分的，另外百花蜜若连巢带蜜一起时也是蜂巢蜜。
