一、蜜源不同
龙眼蜜和百花蜜在蜜源上截然不同，其中龙眼蜜特指蜜蜂采集龙眼树花蜜酿制成的单花蜜，而百花蜜则是蜜蜂采集多种花蜜酿制成的多花蜜，事实上有些龙眼产区的百花蜜中可能就含有龙眼蜜。
二、营养不同
龙眼蜜和百花蜜在营养上略有差异，但主要成分都是葡萄糖和果糖且尚含蔗糖、氨基酸、维生素、矿物质等，区别在于百花蜜中营养成分更丰富，而龙眼蜜则含更多的蛋白质和铁、钾等矿物质。
三、外观不同
龙眼蜜和百花蜜在外观上稍有不同，其中未结晶时两者都是琥珀色的粘稠液体状，但龙眼蜜相对不易结晶且偶有结晶多呈颗粒略粗的琥珀色，而百花蜜则易结晶且结晶后呈颗粒细腻的浅琥珀色。
四、口感不同
龙眼蜜和百花蜜在口感上不尽相同，其中龙眼蜜有浓郁且自然的龙眼香气，口感相对较甜润并有龙眼果实特有的酸味，而百花蜜的天然花香味且气味清香醇厚，味道甜润适口并略有轻微的酸味。
五、价格不同
龙眼蜜和百花蜜在价格上区别明显，其中龙眼蜜一般30～50元一斤，少数品质好的龙眼蜜也可卖到60元以上，而百花蜜一般40～60元一斤，但中蜂采集山野百花酿的土蜂蜜多在100～300元一斤。
综上所述，龙眼蜜和蜂巢蜜是截然不同的两种蜂蜜，其中龙眼蜜是蜜蜂采集龙眼树花蜜酿成的，而百花蜜则是蜜蜂采集多种花蜜酿成的，两者在营养、外观、口感及价格上都有些许差异。
